Odată ce evaluarea a fost finalizată şi obiectivele tratamentului stabilite, se plasează electrozii pe scalp, împreună cu unul sau doi electrozi pe lobul urechilor pentru şedinţa de neuroterapie. Persoana ce urmează a fi antrenată priveşte ecranul computer-ului şi ascultă tonurile audio, uneori în timp ce citeşte. Aceste sesiuni de antrenament sunt proiectate ca să înveţe persoana să schimbe lent şi să reantreneze pattern-ul undelor lor cerebrale. Prin feedback continuu, antrenament şi practică se menţine pattern-ul sănătos al undelor cerebrale. Unele persoane pot necesita învăţarea de a-şi creşte viteza sau mărimea undelor cerebrale în ariile specifice, iar alţii necesită descreşterea vitezei şi a amplitudinii undelor lor cerebrale. Antrenamentul neurofeedback poate necesita doar 15 – 20 şedinţe pentru anxietate sau insomnie, dar pentru afecţiuni ca ADD/ADHD sau dizabilităţile de învăţare vor necesita 40 – 50 şedinţe. Fiecare şedinţă durează în mod normal între 40 şi 60 minute. Atunci când apar afecţiuni foarte complexe sau tulburări multiple, clinicianul nu poate stabili de la început câte şedinţe de tratament pot fi necesare.